L'Université Abdou Moumouni comprend :
- La Faculté d'Agronomie (FA) ;
- La Faculté des Sciences et Techniques (FAST) ;
- La Faculté des Lettres et Sciences Humaines (FLSH) ;
- La Faculté des Sciences de la Santé (FSS) ;
- La Faculté des Sciences Économiques et de Gestion (FSEG) ;
- La Faculté des Sciences Juridiques et Politiques (FSJP) ;
- L'École Normale Supérieure (ENS) ;
- L'Institut de Recherche sur l'Enseignement des Mathématiques (IREM) ;
- L'Institut de Recherche en Sciences Humaines (IRSH) ;
- L'Institut des Radio-isotopes (IRI).